More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2438 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  53.38 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 		 290 aa  315  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  52.31 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 292 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  51.75 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 291 aa  300  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 292 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  52.04 
 
 		 300 aa  298  8e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 290 aa  294  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  54.74 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  54.74 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  51.4 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  53.33 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  52.96 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  50 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 294 aa  279  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 293 aa  278  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 292 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 292 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 292 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 292 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 292 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 290 aa  272  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 292 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  51.42 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  51.06 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  46.07 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>