149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0550 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 278 aa  580  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  55.68 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  46.59 
 
 		 296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  43.93 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  45.82 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  45.09 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  45.09 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  45.09 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 		 308 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  45.79 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  43.84 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  39.48 
 
 		 304 aa  228  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  39.1 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  41.01 
 
 		 284 aa  214  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  37.5 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  40.86 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  38.52 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  39.58 
 
 		 603 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  33.57 
 
 		 301 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  34.15 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  35.94 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  39.93 
 
 		 607 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  34.72 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  31.83 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  33.46 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 322 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  32.89 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  31.05 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  32.95 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.72 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.91 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  32.21 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  27.52 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  29.02 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  30.18 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.42 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.49 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  23.17 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  22.39 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2717  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.62 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  25.38 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  32.08 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  25.4 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.36 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.29 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  21.9 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  25.98 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  19.63 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  21.82 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  23.43 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  22.73 
 
 		 314 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.3 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2918  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  30.34 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  24.15 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  23.94 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 330 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 461 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.44 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  24.22 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.21 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  22.41 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>