162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0018 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  76.02 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  73.3 
 
 
243 aa  302  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  72.4 
 
 
243 aa  300  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  72.48 
 
 
234 aa  295  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  56.5 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  47.67 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  42 
 
 
212 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  43.55 
 
 
214 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  39.69 
 
 
211 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  43.01 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  40.96 
 
 
207 aa  145  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  44.09 
 
 
209 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  43.01 
 
 
210 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  40.86 
 
 
213 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  38.89 
 
 
219 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  38.89 
 
 
219 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  41.88 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.04 
 
 
210 aa  134  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  37.56 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  37.88 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  37.56 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  38.04 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.76 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  39.67 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  34.34 
 
 
283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.78 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  37.43 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 
203 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  35.11 
 
 
203 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  38.04 
 
 
202 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  38.04 
 
 
201 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  35.2 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  33.16 
 
 
203 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  34.59 
 
 
217 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  32.16 
 
 
282 aa  99.4  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  32.61 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  33.68 
 
 
297 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  31.55 
 
 
198 aa  95.1  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  30.4 
 
 
301 aa  94.4  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  32.09 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  36.93 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  29.33 
 
 
296 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  31.7 
 
 
284 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  33.65 
 
 
288 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30.36 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  30.85 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  26.87 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  27.27 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  29.48 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  31.91 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.65 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.28 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  29.51 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  30.43 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  26.37 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  33.87 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  26.37 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  32.02 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.29 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  30.05 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  31.22 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  27.83 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  30.85 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  29.33 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  26.37 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  27.75 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  27.87 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  30.77 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30.85 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  28.99 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  32.65 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  29.48 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  31.12 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  31.52 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  26.15 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.62 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  29.57 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  26.13 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  26.85 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  28.9 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  29.23 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  29.23 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  29.23 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.38 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.87 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  27.93 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  30.05 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  25.68 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  26.24 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  28.49 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  30.12 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  27.03 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  29.17 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  26.01 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  28.49 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  29.5 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  32.11 
 
 
306 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>