More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4059 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 504 aa  640    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  68.85 
 
 		 493 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1002    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 496 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  64.43 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 		 490 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 499 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 503 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 		 490 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  64.81 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 495 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 490 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  65.22 
 
 		 491 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  62.92 
 
 		 512 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 490 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 509 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 		 505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 532 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 506 aa  596  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 492 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  57.78 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 491 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 490 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 506 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 488 aa  350  5e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 486 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 491 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 501 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 495 aa  342  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 487 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 484 aa  339  9e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 469 aa  339  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 484 aa  336  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 492 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 498 aa  335  7.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 485 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 504 aa  332  6e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 506 aa  332  7.000000000000001e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 484 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.65 
 
 		 495 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 491 aa  324  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 514 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 490 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 493 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 478 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  36.98 
 
 		 546 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 481 aa  315  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>