More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3104 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
247 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
249 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 
259 aa  228  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
246 aa  226  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
255 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
254 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  55.17 
 
 
258 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 
245 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  46.31 
 
 
246 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
248 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  44.26 
 
 
1270 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
252 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
247 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
248 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
248 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
252 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
253 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  41.04 
 
 
252 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
252 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
247 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
242 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
247 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
254 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  42.21 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
246 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
231 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
231 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
257 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.39 
 
 
239 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
247 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  42.56 
 
 
239 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
261 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
244 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  39.92 
 
 
1367 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
261 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
244 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
244 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
246 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41 
 
 
243 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
238 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
244 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
252 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  37.14 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
257 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.691417  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
247 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
250 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
245 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
240 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
245 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
240 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
237 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
248 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
248 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
253 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
239 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
251 aa  156  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
244 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
244 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
258 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
261 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
258 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
233 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  43.93 
 
 
283 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
254 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 
317 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  36 
 
 
255 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  36.78 
 
 
247 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
255 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0691518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
230 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.92 
 
 
258 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
250 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  36.29 
 
 
257 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
246 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  36.29 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
246 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
253 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
248 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
248 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
248 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
246 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  37.7 
 
 
253 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
248 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
246 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
250 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>