189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2805 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 369 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  60.76 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  32.35 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.87 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.54 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.26 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.41 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.74 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.67 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  34.69 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  20.4 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  32.67 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  21.38 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  30.68 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.33 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.23 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  29.37 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  30.74 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.14 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  29.1 
 
 		 422 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  30.38 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 407 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 426 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  32.54 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  27.19 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.95 
 
 		 510 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  22.07 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  30.97 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  21.66 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 579 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  32.28 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 397 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  34.86 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.19 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.35 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  28.07 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03573  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  25.59 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.360175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03517  hypothetical protein  25.59 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.394006  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>