More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2734 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  100 
 
 		 446 aa  896    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  59.14 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  51.31 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  48.96 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  48.26 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  49.4 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  48.22 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  47.41 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  46.08 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  46.56 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  45.62 
 
 		 298 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.53 
 
 		 483 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 468 aa  97.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 489 aa  93.2  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 484 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.04 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.89 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.93 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.93 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  24.48 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 518 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  24.48 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  20.66 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  21.39 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  32.19 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  20.58 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  35.81 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.19 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>