More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1743 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  83.39 
 
 		 272 aa  474  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  77.7 
 
 		 279 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  76.3 
 
 		 276 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  75.93 
 
 		 276 aa  424  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.8 
 
 		 262 aa  219  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.03 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  44.54 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  43.75 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 296 aa  198  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.91 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  41.15 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 252 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.32 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  40.87 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.15 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.6 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  41.39 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  42.62 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.14 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  37.76 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  41.27 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  39.51 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 421 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  39.51 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  41.67 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  37.7 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  41.18 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  39.84 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  41.18 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  38.91 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  38.49 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  39.75 
 
 		 359 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  38.14 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  38.49 
 
 		 362 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 397 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  38.91 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.36 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  39.26 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  37.5 
 
 		 333 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.71 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  36.78 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  42.11 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  37.71 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  42.08 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  36.8 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  38.56 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  36.78 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  37.6 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  39.92 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 359 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.98 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  38.14 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  38.02 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  38.14 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  38.14 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.71 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.71 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  37.6 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.17 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  37.19 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  37.6 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  40.34 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.08 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  39.09 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  37.29 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  39.66 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  45.06 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  39.43 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0515  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>