More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1190 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  62.92 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  64.02 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  61.74 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  60.54 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  59.55 
 
 		 283 aa  321  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  61.18 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  61.57 
 
 		 273 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  58.15 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  58.15 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  58.65 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  58.65 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  59.02 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  59.02 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  59.02 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  59.02 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  58.87 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  58.65 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  60.39 
 
 		 273 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  58.53 
 
 		 276 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  58.21 
 
 		 272 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  54.41 
 
 		 265 aa  302  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  58.71 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  58.62 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  54.68 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  57.36 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  60 
 
 		 286 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  57.09 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  55.43 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  55.94 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  55.27 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  56.06 
 
 		 278 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  54.55 
 
 		 283 aa  291  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.55 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  58.1 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  52.19 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 275 aa  288  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  55.25 
 
 		 261 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  52.53 
 
 		 269 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.53 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.61 
 
 		 270 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  55.38 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  54.78 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  56.45 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  52.11 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  52.11 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  52.29 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  50.75 
 
 		 270 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  55.08 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.08 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  49.81 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  49.81 
 
 		 265 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  51.53 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  54.22 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  50.57 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  50.57 
 
 		 269 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  50.94 
 
 		 269 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 267 aa  274  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  54.33 
 
 		 270 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  50.57 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  55.15 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  50.19 
 
 		 269 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 277 aa  271  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  52.47 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  51.12 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  52.09 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  51.12 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  52.09 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  52.09 
 
 		 272 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  51.71 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  51.12 
 
 		 279 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  50.94 
 
 		 274 aa  266  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  52.09 
 
 		 272 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.09 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  55.38 
 
 		 266 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  54.76 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  51.33 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  53.1 
 
 		 268 aa  261  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  50.78 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  52.63 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50.93 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  51.15 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 		 267 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  53.03 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  51.55 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  51.11 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.51 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  52.26 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.51 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.51 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>