86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3362 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
673 aa  1392    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  50.76 
 
 
1049 aa  320  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
1162 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  27.71 
 
 
426 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
1103 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  33.48 
 
 
546 aa  96.3  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  31.68 
 
 
587 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  34.85 
 
 
322 aa  94.4  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
1087 aa  91.3  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  31.13 
 
 
348 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  30.97 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  29.63 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  30.41 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  32.31 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  33.76 
 
 
741 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 
1288 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  25.84 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  29.58 
 
 
424 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  32.91 
 
 
739 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  34.29 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  32.63 
 
 
738 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  27.51 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0892  hypothetical protein  24.24 
 
 
457 aa  64.3  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.986479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  28.98 
 
 
442 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  24.14 
 
 
331 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  23.21 
 
 
331 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  33.33 
 
 
591 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  24.46 
 
 
333 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 
1077 aa  62  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  33.04 
 
 
558 aa  61.6  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  33.06 
 
 
525 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  25 
 
 
325 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  23.1 
 
 
331 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  23.02 
 
 
331 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  25 
 
 
325 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  33.33 
 
 
394 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  26 
 
 
638 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  30.71 
 
 
570 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  25.94 
 
 
369 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  28.72 
 
 
1837 aa  53.9  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.67 
 
 
703 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
557 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  27.78 
 
 
569 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  22.67 
 
 
331 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  28.83 
 
 
353 aa  50.8  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
691 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  22.54 
 
 
388 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
691 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.91 
 
 
700 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
753 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  37.25 
 
 
375 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
683 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 
401 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
994 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
311 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
691 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  25.21 
 
 
340 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  26.4 
 
 
351 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  36.51 
 
 
860 aa  47.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  31.71 
 
 
435 aa  47.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  32.11 
 
 
376 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  39.36 
 
 
439 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  36.27 
 
 
375 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
1267 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  22.58 
 
 
1435 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  35.42 
 
 
369 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  39.09 
 
 
432 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1438  hypothetical protein  22.33 
 
 
340 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
337 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  37.25 
 
 
370 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
310 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  35.29 
 
 
579 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
306 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  36.27 
 
 
385 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  34.88 
 
 
369 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  33.72 
 
 
369 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
1737 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  31.48 
 
 
868 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
303 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  30.51 
 
 
649 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
892 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46968  predicted protein  33.01 
 
 
475 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
324 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  32.67 
 
 
373 aa  43.9  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
406 aa  43.9  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>