More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1783 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  100 
 
 		 317 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  57.06 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  57.06 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  65.62 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  64.84 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  62.5 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  66.15 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.57 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 204 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.69 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 535 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  50.91 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 452 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  53.49 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  52.83 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50.49 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 417 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 370 aa  99  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.12 
 
 		 235 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.86 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  52.13 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  51.58 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 524 aa  97.4  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.41 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.86 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  48.45 
 
 		 164 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  33.67 
 
 		 476 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50.53 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  43.9 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  46.08 
 
 		 232 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  34.47 
 
 		 393 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.96 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 372 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 370 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 293 aa  92.8  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.97 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.71 
 
 		 438 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 257 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.87 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  43.33 
 
 		 197 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 162 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.71 
 
 		 1048 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  46.3 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.32 
 
 		 556 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  42.34 
 
 		 174 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.13 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  44.83 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.36 
 
 		 475 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  33.52 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  45 
 
 		 378 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.95 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 236 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  49.48 
 
 		 278 aa  89.7  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 378 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0234  hypothetical protein  40 
 
 		 403 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 432 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  48.35 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  53.26 
 
 		 349 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 232 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 200 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 381 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52.75 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  48.35 
 
 		 257 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 208 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  51.06 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 446 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 502 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  41.75 
 
 		 363 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 348 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.32 
 
 		 372 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43 
 
 		 363 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 225 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.36 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  50.56 
 
 		 368 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.98 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.8 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  41.38 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  48.31 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  52.33 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>