More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1882 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  92.89 
 
 		 225 aa  434  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  79.23 
 
 		 221 aa  352  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  75.56 
 
 		 219 aa  350  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  73.21 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  73.3 
 
 		 222 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  69.2 
 
 		 226 aa  299  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  65.58 
 
 		 216 aa  299  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  61.97 
 
 		 214 aa  289  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  58.54 
 
 		 219 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  57.07 
 
 		 199 aa  234  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  55.45 
 
 		 200 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  53.37 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  53.54 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  52.24 
 
 		 198 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  50.23 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  51.02 
 
 		 190 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  55.91 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  45 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  53.2 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  45.69 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  43.78 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.33 
 
 		 262 aa  167  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  41.67 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  43.18 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  43.18 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  42.92 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  42.35 
 
 		 267 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  35.18 
 
 		 276 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  37.12 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  34.71 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  43.4 
 
 		 274 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  39.62 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  39.62 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  43.66 
 
 		 284 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  43.19 
 
 		 284 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  43.19 
 
 		 284 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  32.81 
 
 		 276 aa  155  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  45.6 
 
 		 171 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  36.82 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  37.07 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  37.07 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  37.99 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  41.78 
 
 		 284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  41.51 
 
 		 284 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  41.43 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  41.04 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  41.01 
 
 		 262 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  40.17 
 
 		 284 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  41.31 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  32.64 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  41.78 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  38.72 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  38.7 
 
 		 299 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  39.05 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  34.44 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  44.02 
 
 		 173 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  38.32 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  38.4 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  39.72 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  39.9 
 
 		 297 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  34.26 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  39.34 
 
 		 284 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  38.89 
 
 		 305 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  40.64 
 
 		 185 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  39.34 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  38.03 
 
 		 256 aa  144  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  41.36 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  38.03 
 
 		 256 aa  144  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  40.1 
 
 		 324 aa  144  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  38.32 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  38.36 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  41.11 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  36.49 
 
 		 268 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  37.04 
 
 		 310 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  38.14 
 
 		 263 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  38.32 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  38.86 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  35.96 
 
 		 342 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  37.5 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  36.11 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  40.66 
 
 		 174 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  40 
 
 		 181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2196  signal peptidase I  53.98 
 
 		 340 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.67 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  35.02 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.67 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  37.99 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  36.24 
 
 		 321 aa  134  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  41.34 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  38.29 
 
 		 305 aa  134  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  37.2 
 
 		 264 aa  134  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  37.99 
 
 		 305 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  37.99 
 
 		 305 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  38.67 
 
 		 297 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  40.84 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  38.22 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  38.22 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  38.22 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>