183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3357 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  72.9 
 
 
165 aa  240  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  93.33 
 
 
120 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  52.53 
 
 
167 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  37.58 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.68 
 
 
599 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  34.34 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.96 
 
 
599 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  37.58 
 
 
220 aa  77  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  36.69 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  31.82 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  38.85 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  39.06 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  35.29 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  36.36 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  35.29 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  36.96 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  32.41 
 
 
351 aa  67.4  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  30.2 
 
 
354 aa  67.4  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  28.82 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  36.84 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  30 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  31.65 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  35.04 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0048  Appr-1-p processing domain-containing protein  38.22 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  33.85 
 
 
694 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  34.04 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  34.38 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  38.84 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  37.4 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  35.61 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  34.39 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  31.36 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  39.17 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  35.19 
 
 
358 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  35.25 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  33.82 
 
 
196 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  35.53 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  32.85 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  34.81 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  36.97 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  31.45 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  37.7 
 
 
184 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  36.89 
 
 
577 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  36.36 
 
 
186 aa  60.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  34.81 
 
 
186 aa  60.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  36.3 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  37.07 
 
 
196 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  34.84 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  31.17 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  38.14 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  32.43 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  30.26 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  28.57 
 
 
190 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  35.43 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  29.53 
 
 
341 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  34.06 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  27.61 
 
 
242 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  36.62 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  30.59 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  34.87 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  40.65 
 
 
178 aa  58.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  36.07 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  33.09 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  34.33 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  30.99 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  34.07 
 
 
193 aa  57.8  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  33.85 
 
 
181 aa  57.4  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  32.35 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  32.3 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  33.58 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  29.88 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  31.29 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  34.33 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  36.89 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  33.09 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  30.23 
 
 
331 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  30.99 
 
 
357 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  35.25 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  35.29 
 
 
177 aa  53.9  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  30 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  33.81 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  28.29 
 
 
345 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  35.29 
 
 
374 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  30.67 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  32.14 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  33.09 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  32.03 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  34.07 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  33.33 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  29.05 
 
 
352 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  32.45 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>