50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0391 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  100 
 
 		 341 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  39.38 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  36.3 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  36.03 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  34.53 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  36.75 
 
 		 357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  34.67 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  36.42 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  35.26 
 
 		 345 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  34.98 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  32.46 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  32.59 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  34.49 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  36.48 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  34.94 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  34.2 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  33.24 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  31.72 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  42.67 
 
 		 150 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  32.31 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  41.01 
 
 		 242 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  38.99 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  37.5 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  28.87 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  29.41 
 
 		 163 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  24.31 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  28.03 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  25.68 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  29.25 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  27.46 
 
 		 167 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  23.88 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  25.93 
 
 		 179 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0749  appr-1-p processing domain-containing protein  29.41 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  24.7 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  29.58 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  26.09 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  24.68 
 
 		 179 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  26.22 
 
 		 176 aa  46.2  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0191  Appr-1-p processing domain protein  26.06 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  28.36 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1996  appr-1-p processing domain-containing protein  26.51 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  25 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  26.12 
 
 		 182 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  24.46 
 
 		 179 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  24.29 
 
 		 179 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  23.74 
 
 		 179 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  23.74 
 
 		 179 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  29.08 
 
 		 177 aa  43.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>