44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0936 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
349 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  68.21 
 
 
346 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  65.33 
 
 
351 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  62.97 
 
 
345 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  64.66 
 
 
353 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  65.77 
 
 
357 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  59.6 
 
 
354 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  47.88 
 
 
351 aa  345  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  50 
 
 
331 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  48.13 
 
 
353 aa  332  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  45.61 
 
 
345 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  43.3 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  41.29 
 
 
362 aa  269  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  57.99 
 
 
254 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  41.83 
 
 
355 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  40.06 
 
 
356 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  38.69 
 
 
360 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  40.94 
 
 
362 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  39.04 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  36.3 
 
 
341 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  50.34 
 
 
150 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  45.76 
 
 
136 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  41.13 
 
 
242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  31.58 
 
 
393 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  31.76 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.81 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  28.85 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  26.87 
 
 
163 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  27.86 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  28.21 
 
 
168 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  28 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  32.14 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  31.25 
 
 
152 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  28.26 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  29.01 
 
 
147 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  31.46 
 
 
120 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  28.76 
 
 
179 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  24.83 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  29.03 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3993  hypothetical protein  25.37 
 
 
141 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  23.63 
 
 
190 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  28.09 
 
 
173 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  23.81 
 
 
173 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  25.49 
 
 
161 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>