43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0297 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  64.83 
 
 		 351 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  62.68 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  60.12 
 
 		 346 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  59.6 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  64.05 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  59.04 
 
 		 353 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  47.58 
 
 		 351 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  48.51 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  47.93 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  45.3 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  45.45 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  43.23 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  43.86 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  57.53 
 
 		 254 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  47 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  43.44 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  40.8 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  40.37 
 
 		 397 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  36.42 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  50.34 
 
 		 150 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  45.3 
 
 		 136 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  38.06 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  31.9 
 
 		 392 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  30.25 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  32.52 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  31.54 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  31.58 
 
 		 165 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  32.84 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  27.85 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  31.78 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  27.97 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  25 
 
 		 152 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  28.21 
 
 		 179 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  32.56 
 
 		 120 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  25.32 
 
 		 161 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  20.86 
 
 		 173 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  23.86 
 
 		 179 aa  46.2  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  34.95 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  25.31 
 
 		 159 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  27.13 
 
 		 184 aa  42.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>