184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3196 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  72.9 
 
 		 162 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  70.54 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  46.3 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  37.76 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  32.93 
 
 		 599 aa  77.8  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  32.93 
 
 		 599 aa  77.4  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  33.53 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  33.12 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  33.12 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  30.67 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  31.58 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  34.39 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  34.19 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  34.27 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  36.23 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  31.72 
 
 		 351 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  36.67 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  34.56 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  37.1 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  36.73 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  28 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  32.93 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  36.25 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  34.71 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  36.8 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  36.59 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  32.32 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1415  Appr-1-p processing domain protein  35.16 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  32.37 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1789  Appr-1-p processing domain protein  35.43 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3185  appr-1-p processing domain-containing protein  36.07 
 
 		 577 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0048  Appr-1-p processing domain-containing protein  37.76 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  31.36 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  30.38 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  35.97 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  34.96 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2600  Appr-1-p processing domain protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1425  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585547  normal  0.264333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  32.32 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01049  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1165  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.472245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  37.59 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  32.47 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  27.39 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  34.85 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  30.91 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  37.4 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  36.59 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  33.33 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  32.68 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  30.86 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  33.33 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  39.37 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  30.38 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  38.33 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  26.38 
 
 		 362 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3492  Appr-1-p processing domain protein  30.36 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  34.65 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  29.75 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  32.32 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  29.25 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  38.41 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4618  Appr-1-p processing domain protein  30.77 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  27.49 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  32.26 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0998  appr-1-p processing domain-containing protein  31.65 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  35.83 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  32.09 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3405  Appr-1-p processing domain protein  35.77 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  34.87 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  33.33 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  32.79 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  35.29 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  35.83 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  30.94 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  35.11 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  33.77 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  32.79 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  31.91 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  31.85 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  34.4 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  29.86 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0557  Appr-1-p processing domain protein  35.25 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  33.06 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  28.46 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  32.09 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  32.09 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  31.34 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  33.8 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  31.34 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  31.52 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  31.34 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.166564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>