44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1489 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  100 
 
 		 331 aa  686    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  74.62 
 
 		 351 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  58.13 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  53.13 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  48.95 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  47.16 
 
 		 345 aa  308  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  48.51 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  45.37 
 
 		 351 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  43.79 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  40.52 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  39.71 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  40.71 
 
 		 356 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  39.89 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  41.28 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  39.24 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  32.46 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  56.72 
 
 		 150 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  41.1 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  49.56 
 
 		 136 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  44.92 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  35.62 
 
 		 393 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  35.1 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  34.35 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  28.57 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  30.7 
 
 		 158 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  31.78 
 
 		 152 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  31.86 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  30.16 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  29.79 
 
 		 161 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  30.58 
 
 		 162 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  29.46 
 
 		 165 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  30.63 
 
 		 147 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  26.77 
 
 		 152 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  26.38 
 
 		 190 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  27.54 
 
 		 179 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0421  hypothetical protein  26.13 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0143355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  27.83 
 
 		 167 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1823  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1357  hypothetical protein  29.63 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2261  hypothetical protein  28.83 
 
 		 193 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000021907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  30.49 
 
 		 120 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>