39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3529 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 346 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  68.21 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  66.28 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  64.56 
 
 		 357 aa  464  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  62.43 
 
 		 351 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  61.52 
 
 		 345 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  60.12 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  51 
 
 		 351 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  48.99 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  50 
 
 		 331 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  47.26 
 
 		 345 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 352 aa  269  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  42.29 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  44.78 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  41.53 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  42.7 
 
 		 356 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  53.24 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  39.66 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  40.62 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  34.98 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  48.99 
 
 		 150 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  49.57 
 
 		 136 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  40.14 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  31.75 
 
 		 393 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  34.06 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  32.31 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  30.67 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  32.54 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.28 
 
 		 168 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  31.4 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  28.79 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.58 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  26.03 
 
 		 152 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  25.87 
 
 		 167 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  26.92 
 
 		 179 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  25.79 
 
 		 161 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  32 
 
 		 120 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  24.6 
 
 		 190 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>