31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3219 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 
120 aa  243  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  93.33 
 
 
162 aa  205  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  69.3 
 
 
165 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  31.07 
 
 
349 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  31.63 
 
 
354 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  34.91 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  28.28 
 
 
346 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  30.86 
 
 
341 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  29.79 
 
 
331 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1745  Appr-1-p processing domain protein  33.68 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  32.48 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05810  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  38.75 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.198102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  33.66 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  28.44 
 
 
242 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  31.71 
 
 
694 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  30.3 
 
 
351 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  32.63 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  27.36 
 
 
345 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  30.83 
 
 
220 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  34.18 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  29.03 
 
 
175 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  32.71 
 
 
358 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  30 
 
 
362 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  28.43 
 
 
357 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  36.51 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  29.29 
 
 
352 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0153  appr-1-p processing domain-containing protein  29.59 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0194  hypothetical protein  31.53 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.45339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  30.69 
 
 
168 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>