39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0142 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  53.99 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  52.76 
 
 		 168 aa  170  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  52.53 
 
 		 179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  30.28 
 
 		 354 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  27.81 
 
 		 349 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  31.29 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  27.45 
 
 		 353 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  29.22 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  28.87 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  28.57 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  30.7 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  27.92 
 
 		 351 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  27.63 
 
 		 362 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  26.14 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  27.74 
 
 		 351 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  27.61 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  27.63 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  27.46 
 
 		 353 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  26.53 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  28.57 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  26.11 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  24.68 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  26.05 
 
 		 242 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  27.12 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  25.49 
 
 		 352 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  33.79 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2930  Appr-1-p processing domain protein  26.54 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00352819  hitchhiker  0.00887383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  28.23 
 
 		 397 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  21.47 
 
 		 393 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  26.5 
 
 		 357 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  32.89 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3219  Appr-1-p processing domain protein  35.48 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  21.52 
 
 		 392 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  25.95 
 
 		 454 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2376  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0220429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3993  hypothetical protein  48.78 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  31.58 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>