34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5129 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  77.78 
 
 		 360 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  74.72 
 
 		 356 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  63.56 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  60.45 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  44.37 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  40.94 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  37.3 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  41.49 
 
 		 351 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  39.66 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  38.87 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  38.95 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  40.8 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  40.32 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  43.96 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  37.29 
 
 		 353 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  39.24 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  34.07 
 
 		 353 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  33.24 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  46.81 
 
 		 150 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  42.45 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  43.9 
 
 		 136 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  31.48 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  33.33 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.63 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  27.7 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  27.1 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.45 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  25 
 
 		 146 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  23.66 
 
 		 179 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  25.69 
 
 		 190 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  25 
 
 		 161 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0749  appr-1-p processing domain-containing protein  26.09 
 
 		 156 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>