35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4398 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  57.53 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  40.14 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  34.09 
 
 		 345 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  32.31 
 
 		 346 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  32.52 
 
 		 354 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  31.34 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  31.34 
 
 		 353 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  30 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  33.98 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  30.28 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  34.35 
 
 		 331 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  26.87 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  32.86 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  31.34 
 
 		 352 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  27.86 
 
 		 349 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  31.15 
 
 		 357 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  30.37 
 
 		 355 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  29.55 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  26.4 
 
 		 353 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  28.67 
 
 		 360 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  27.97 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0749  appr-1-p processing domain-containing protein  28.26 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  23.88 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  24.49 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  28.66 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  28.03 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  28.38 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  25 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  24.36 
 
 		 393 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  25.32 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  28 
 
 		 397 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2091  Appr-1-p processing domain protein  25.56 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  24.49 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>