32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1158 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  819    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  54.86 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  35.5 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  38.99 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  31.9 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  35.1 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  33.54 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  41.22 
 
 		 136 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  31.76 
 
 		 349 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  30.86 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  32.32 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  34.06 
 
 		 346 aa  90.9  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  33.54 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  33.75 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  34.93 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  34.52 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  31.45 
 
 		 351 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  31.71 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  31.55 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  36.09 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  32.12 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  33.54 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  27.11 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  24.49 
 
 		 146 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  25 
 
 		 152 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2100  hypothetical protein  29.73 
 
 		 223 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.000000000059812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  23.08 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  22.94 
 
 		 168 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  21.12 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0322  hypothetical protein  27.84 
 
 		 273 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>