32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0073 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  815    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  54.86 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  35.62 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  33.88 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  31.58 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  32.04 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  31.75 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  37.5 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  32.76 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  34.38 
 
 		 150 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  31.01 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  30.25 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  34.18 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  33.74 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  32.91 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  33.33 
 
 		 355 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  39.39 
 
 		 136 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  32.28 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  34.34 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  32.72 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  31.48 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  29.75 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  30.18 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  30 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.75 
 
 		 168 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.11 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  21.47 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  24.36 
 
 		 146 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  25.28 
 
 		 179 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0296  hypothetical protein  25.37 
 
 		 226 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3595  hypothetical protein  38.67 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000317158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>