35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1300 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  50.41 
 
 		 352 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  49.57 
 
 		 346 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  49.56 
 
 		 331 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  44.07 
 
 		 353 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  45.3 
 
 		 354 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  46.03 
 
 		 242 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  47.01 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  47.79 
 
 		 345 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  47.79 
 
 		 351 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  46.15 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  45.76 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  47.41 
 
 		 357 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  45.61 
 
 		 351 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  46.15 
 
 		 353 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  44.44 
 
 		 341 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  45.3 
 
 		 355 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  46.28 
 
 		 356 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  43.9 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  44.54 
 
 		 360 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  40.17 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  44.04 
 
 		 397 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  41.22 
 
 		 392 aa  93.2  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  39.39 
 
 		 393 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  33.98 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  31.45 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  29.51 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.12 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.4 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  25.6 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  26.4 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  29 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0661  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 379 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  28.21 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  27.35 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>