38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2730 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 163 aa  327  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  40.14 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  27.52 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  30.18 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  32.33 
 
 		 362 aa  73.9  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  32.03 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  31.29 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  39.42 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  31.54 
 
 		 354 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  29.05 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  31.58 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  28.38 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  29.41 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  29.53 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  26.87 
 
 		 349 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  26.87 
 
 		 351 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  28.57 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  29.73 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  27.7 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  33.94 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  26.06 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  25.69 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  27.11 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  29.05 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  28.35 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  29.51 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  28.79 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  34.48 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  28.91 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  29.03 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  27.41 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  21.53 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  30.87 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  29.29 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  34.92 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2091  Appr-1-p processing domain protein  24.44 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0421  hypothetical protein  33.61 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0143355  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  25.62 
 
 		 173 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>