36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0862 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 355 aa  734    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  63.74 
 
 		 360 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  63.56 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  65.81 
 
 		 356 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  57.63 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  42.54 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  41.83 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  42.18 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  44.78 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  39.89 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  43.86 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  40.12 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  43.67 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  40.12 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  42.81 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  38.31 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  39.71 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  36.96 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  34.2 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  45.64 
 
 		 150 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  41.98 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  45.3 
 
 		 136 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  32.86 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  34.52 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  31.58 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  30.37 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  28.35 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  24.68 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.88 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.25 
 
 		 168 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  25.33 
 
 		 167 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  22.67 
 
 		 165 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  28.96 
 
 		 179 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01180  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  25 
 
 		 188 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  25.89 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>