32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1715 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  820    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  41.54 
 
 
360 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  43.32 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  42.81 
 
 
355 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  41.28 
 
 
331 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  41.05 
 
 
345 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  38.95 
 
 
362 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  42.81 
 
 
357 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  38.39 
 
 
352 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  40.73 
 
 
349 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  37.96 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  40.62 
 
 
346 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  40.3 
 
 
353 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  37.94 
 
 
351 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  40 
 
 
362 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  40.37 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  37.58 
 
 
351 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  36.47 
 
 
353 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  32.31 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  43.41 
 
 
150 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  34.1 
 
 
254 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  42.52 
 
 
242 aa  97.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  44.55 
 
 
136 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  33.54 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  30 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  21.53 
 
 
163 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.57 
 
 
168 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  28 
 
 
146 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  29.6 
 
 
152 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  27.78 
 
 
152 aa  43.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  25.87 
 
 
168 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>