18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1069 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3993  hypothetical protein  64.29 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2376  hypothetical protein  60 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0220429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0421  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0143355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1357  hypothetical protein  53.9 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  29.01 
 
 		 349 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  30.63 
 
 		 331 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  27.59 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  31.86 
 
 		 362 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  27.68 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  29 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  28.28 
 
 		 345 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  34.95 
 
 		 354 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  34.92 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  26.55 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  27.34 
 
 		 392 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  31.43 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>