More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2550 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  88.94 
 
 		 226 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  73.42 
 
 		 225 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  73.42 
 
 		 225 aa  348  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  73.42 
 
 		 225 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  72.97 
 
 		 225 aa  347  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  72.97 
 
 		 225 aa  347  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  72.52 
 
 		 225 aa  346  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  72.52 
 
 		 225 aa  344  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  72.97 
 
 		 225 aa  344  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  72.52 
 
 		 225 aa  343  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  61.67 
 
 		 227 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  60.91 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  71.35 
 
 		 186 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  71.59 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  57.4 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  51.8 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  53.05 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  55.86 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  53.88 
 
 		 227 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  53.42 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  51.35 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  54.09 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  51.9 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  46.4 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  48.57 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  50.92 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  48.66 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  48.21 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  48.87 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  50.75 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 234 aa  204  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  46.05 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  45.95 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  43.17 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  46.85 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  46.72 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  46.4 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  51.36 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  45.95 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  43.84 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  45.81 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  44.16 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  49.76 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  44.09 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  44.1 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  43.18 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  44.95 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  43.67 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  45.71 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  45.05 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  44.95 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  42.65 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  43.52 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  44.81 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  52.83 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  44.98 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  44.24 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  40.69 
 
 		 243 aa  178  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  40.09 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  43.11 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  40.85 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1718  DNA repair protein RadC  48.02 
 
 		 184 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1752  DNA repair protein RadC  48.02 
 
 		 184 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.64 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  39.39 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  39.19 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>