More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1103 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  54.67 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 215 aa  214  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  41.9 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  41.9 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  37.79 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  39.81 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  39.17 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 214 aa  160  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  41.43 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  41.43 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  39.07 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3526  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  38.07 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>