65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4475 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  64.19 
 
 		 763 aa  942    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 761 aa  1571    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  58.06 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1642 aa  292  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  31.83 
 
 		 1649 aa  285  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  31.85 
 
 		 1669 aa  282  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  32.74 
 
 		 1669 aa  280  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  35.27 
 
 		 1706 aa  280  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  35.68 
 
 		 2098 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  32.99 
 
 		 1925 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  33.52 
 
 		 1722 aa  278  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  33.58 
 
 		 1932 aa  275  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  33.64 
 
 		 1934 aa  269  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  32.45 
 
 		 2274 aa  264  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  28.94 
 
 		 2077 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  31.5 
 
 		 1726 aa  257  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 1575 aa  253  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  31.25 
 
 		 1606 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  31.72 
 
 		 2117 aa  239  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  25.67 
 
 		 1674 aa  237  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  29.7 
 
 		 1697 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  30.02 
 
 		 1697 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  30.5 
 
 		 1700 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 1516 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 1693 aa  225  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  26.63 
 
 		 1703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  29.08 
 
 		 1702 aa  221  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1748 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  30.2 
 
 		 2570 aa  217  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  28.62 
 
 		 1701 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  27.21 
 
 		 2005 aa  197  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  26.77 
 
 		 1956 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  27.29 
 
 		 1594 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 976 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  29.36 
 
 		 1417 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  26.5 
 
 		 766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  23.78 
 
 		 1211 aa  124  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.06 
 
 		 678 aa  92.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  20.26 
 
 		 1379 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  35 
 
 		 958 aa  58.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  26.74 
 
 		 953 aa  58.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  35 
 
 		 958 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  32.35 
 
 		 933 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  39.02 
 
 		 969 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  29.2 
 
 		 986 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  24.93 
 
 		 1181 aa  50.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  21.34 
 
 		 1069 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  36.36 
 
 		 950 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  20.05 
 
 		 1080 aa  48.5  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  21.34 
 
 		 1069 aa  48.5  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  20.92 
 
 		 1125 aa  47.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  26.32 
 
 		 957 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  42.37 
 
 		 894 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  27.68 
 
 		 946 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  22.29 
 
 		 572 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 940 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  21.93 
 
 		 777 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.9 
 
 		 919 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.91 
 
 		 801 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  37.5 
 
 		 1065 aa  45.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  29.7 
 
 		 949 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 968 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  35.38 
 
 		 900 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  23.57 
 
 		 1031 aa  44.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.56 
 
 		 805 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>