More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0226 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  71.96 
 
 
290 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  56.64 
 
 
269 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  46.48 
 
 
256 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  42.92 
 
 
254 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
253 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  39.84 
 
 
262 aa  168  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  42.92 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  42.92 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  42.92 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  42.92 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  42.92 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  42.92 
 
 
254 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  42.92 
 
 
235 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  36.05 
 
 
250 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  36.05 
 
 
250 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
250 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  37.25 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  37.93 
 
 
252 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  38.36 
 
 
252 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  36.11 
 
 
252 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  40.62 
 
 
275 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  36.11 
 
 
252 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  38.36 
 
 
252 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  36.11 
 
 
252 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  36.11 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  36.11 
 
 
252 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  35.71 
 
 
252 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 
252 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 
251 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  36.54 
 
 
252 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
249 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  39.42 
 
 
250 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  35.18 
 
 
250 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  37.16 
 
 
252 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  38.17 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  38.97 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  36.94 
 
 
252 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  42.78 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  37.2 
 
 
251 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  42.13 
 
 
253 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  42.25 
 
 
253 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  41.58 
 
 
253 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  37.28 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  41.18 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  41.18 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  35.18 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  41.18 
 
 
604 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  37.09 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  36.78 
 
 
261 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.94 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  33.12 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.81 
 
 
494 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  28.73 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  33.13 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  33.13 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  27.72 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  25.2 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.68 
 
 
436 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.13 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.19 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.55 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.31 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  27.91 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 
492 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 
489 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  26.38 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  31.33 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 
529 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  30.06 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  26.29 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.89 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  24.66 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  23.68 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  31.1 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.04 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  25.19 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  27.95 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  29.51 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
513 aa  68.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  33.76 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  27.43 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.11 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  25.29 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>