62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2141 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  295  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  70.11 
 
 
411 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  70.11 
 
 
411 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  70.11 
 
 
411 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  67.42 
 
 
255 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  52.78 
 
 
398 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  46.07 
 
 
428 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  53.52 
 
 
431 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  53.52 
 
 
426 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  54.93 
 
 
446 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  54.93 
 
 
446 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  54.93 
 
 
430 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  57.35 
 
 
412 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  44.44 
 
 
428 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  41.67 
 
 
411 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  41.18 
 
 
417 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1682  Rac prophage; integrase  64.44 
 
 
46 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.125194  normal  0.0274257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1776  Rac prophage; integrase  64.44 
 
 
46 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.97302  normal  0.0851473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  38.81 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  41.67 
 
 
401 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  41.67 
 
 
402 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  35.48 
 
 
436 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  31.71 
 
 
412 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  36.49 
 
 
190 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  36.62 
 
 
273 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  44.26 
 
 
396 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  39.29 
 
 
403 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  35.48 
 
 
452 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  37.5 
 
 
407 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.57 
 
 
390 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.83 
 
 
407 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.4 
 
 
393 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  34.25 
 
 
359 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  30.49 
 
 
446 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  35 
 
 
375 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  35.21 
 
 
391 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  29.17 
 
 
392 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  29.17 
 
 
392 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  34.78 
 
 
356 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2271  hypothetical protein  32 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000219474  hitchhiker  0.000127881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  33.93 
 
 
401 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  33.85 
 
 
386 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  30.67 
 
 
414 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  39.68 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  32 
 
 
338 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  25.53 
 
 
418 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  28.75 
 
 
385 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  32.43 
 
 
388 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.17 
 
 
433 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  29.11 
 
 
381 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  23.08 
 
 
471 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0194  phage integrase  38.71 
 
 
333 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  32.14 
 
 
397 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  30.36 
 
 
411 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  35.71 
 
 
384 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  24 
 
 
435 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.58 
 
 
414 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  28.57 
 
 
293 aa  42.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  32.53 
 
 
493 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  39.13 
 
 
397 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  30.68 
 
 
292 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  34.29 
 
 
403 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>