23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1682 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01322  integrase  95.65 
 
 		 411 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  95.65 
 
 		 411 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  95.65 
 
 		 411 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1682  Rac prophage; integrase  100 
 
 		 46 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.125194  normal  0.0274257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1776  Rac prophage; integrase  97.83 
 
 		 46 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.97302  normal  0.0851473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  71.74 
 
 		 255 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  63.04 
 
 		 428 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  63.04 
 
 		 426 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  63.04 
 
 		 431 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  63.04 
 
 		 398 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  64.44 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  58.7 
 
 		 446 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  58.7 
 
 		 446 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  54.35 
 
 		 428 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  52.17 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  57.78 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  43.9 
 
 		 417 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  39.13 
 
 		 411 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  41.03 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  46.88 
 
 		 401 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  46.88 
 
 		 402 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  48.57 
 
 		 396 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  46.67 
 
 		 407 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>