154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0239 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  85.55 
 
 
443 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  85.55 
 
 
443 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  917    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  98.65 
 
 
443 aa  907    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  98.65 
 
 
443 aa  906    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  53.83 
 
 
448 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  53.83 
 
 
448 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  46.53 
 
 
444 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  47.07 
 
 
445 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  46.85 
 
 
445 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  45.5 
 
 
445 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  45.05 
 
 
445 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  41.31 
 
 
444 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  42.08 
 
 
444 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  41.57 
 
 
445 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  39.37 
 
 
444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  41.99 
 
 
445 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  37.56 
 
 
444 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  41.53 
 
 
445 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  37.33 
 
 
444 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  41.22 
 
 
445 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  38.91 
 
 
443 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  38.1 
 
 
441 aa  315  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  37.41 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  39.14 
 
 
444 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  38.12 
 
 
445 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  36.65 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  37.64 
 
 
445 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  36.83 
 
 
472 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  35.73 
 
 
467 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  37.58 
 
 
455 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  35.73 
 
 
467 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  35.73 
 
 
467 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  35.73 
 
 
467 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  35.73 
 
 
467 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  35.73 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.2 
 
 
443 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  35.75 
 
 
454 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  35.5 
 
 
468 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.75 
 
 
458 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  35.62 
 
 
442 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  36.1 
 
 
449 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  36.1 
 
 
449 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  36.1 
 
 
449 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  34.46 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  35.87 
 
 
443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  35.96 
 
 
443 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  35.36 
 
 
443 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  36.4 
 
 
443 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  36.18 
 
 
443 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  35.27 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  34.76 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.57 
 
 
446 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  35.75 
 
 
448 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34.9 
 
 
447 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  34.31 
 
 
440 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  35.06 
 
 
449 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  34.45 
 
 
448 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  34.38 
 
 
449 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  34.38 
 
 
452 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  34.38 
 
 
480 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  34.16 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  34.82 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.93 
 
 
447 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  34.01 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  34.01 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  34.01 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  33.78 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  35.78 
 
 
432 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  35.63 
 
 
448 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  35.63 
 
 
448 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  35.41 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  35.63 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  35.63 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  35.63 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  35.63 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  34.74 
 
 
447 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  35.04 
 
 
448 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  31.58 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  32.37 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.66 
 
 
446 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  41.38 
 
 
301 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.19 
 
 
445 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  33.09 
 
 
416 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  31.63 
 
 
451 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  31.63 
 
 
451 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  27.23 
 
 
444 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  28.03 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0728  hypothetical protein  29.26 
 
 
450 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0800  type VI secretion protein  29.26 
 
 
450 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  26.39 
 
 
447 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0174  hypothetical protein  29.26 
 
 
450 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2509  hypothetical protein  29.26 
 
 
450 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  26.16 
 
 
447 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0779  hypothetical protein  29.63 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  26.35 
 
 
448 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  26.58 
 
 
448 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  27.19 
 
 
433 aa  166  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  27.21 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  30.63 
 
 
453 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>