107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2027 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  69.11 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  39.34 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  34.4 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 131 aa  83.6  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  32.8 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  33.33 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  32.8 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  32.8 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  31.75 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  32.5 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  33.62 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  28.45 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  25.81 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  30.77 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  27.42 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  25.64 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  25.64 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  29.66 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  24.17 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  24.58 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  28.21 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  24.58 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  24.55 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  23.93 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  34.29 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  27.12 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  25.23 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.32 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  29.82 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  21.31 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  25 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  23.53 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  25.62 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  31.31 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  22.41 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  23.33 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  28.75 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  24.17 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  21.19 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  28.75 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  24.76 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  22.31 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  30.3 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  22.5 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  26.32 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  30.77 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  25 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  24.3 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  24.3 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  26.09 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  26.27 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  27.03 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  25.64 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  24.77 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>