129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1553 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  41.99 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  32.06 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  30.32 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  29.3 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0666  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000195734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.61 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.22 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  32.09 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.88 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.35 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.71 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.73 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.16 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.81 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.21 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.01 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.1 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  22.22 
 
 		 174 aa  51.2  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21260  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.1 
 
 		 209 aa  51.2  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.682268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.19 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  21.89 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.15 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2618  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.65 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0277117  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  30.08 
 
 		 451 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.21 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  42.19 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 331 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  35.59 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.78 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  34.09 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.59 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1382  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.82 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.04 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  28.74 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.33 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  26.67 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  28.08 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  24.81 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  28.38 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  28.38 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  36.84 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  36.84 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.81 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.57 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2029  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0672691  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.68 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.28 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  23.91 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  34.12 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.37 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  35.53 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  44.44 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.17 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.91 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  24.47 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.36 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  34.33 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>