More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0983 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  68.55 
 
 		 227 aa  224  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  55.06 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  54.72 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  57.23 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  56.89 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  56.6 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  57.86 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  55.35 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  51.89 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  55.35 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  55.35 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  55.35 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  55.35 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  55.35 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  50 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  52.76 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  52.83 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  55.97 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  46.15 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  50.62 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  47.85 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  47.24 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  44.79 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  46.75 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  44.97 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  47.47 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  46.84 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  44.64 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  49.07 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  49.07 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  47.47 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  46.2 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  47.83 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  45.4 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  47.2 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  44.97 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  44.85 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  53.28 
 
 		 169 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  43.29 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  43.02 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  56.3 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  40.88 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  39.16 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  42.94 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  38.04 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  51.26 
 
 		 163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  40.22 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  43.21 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  52.14 
 
 		 166 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  54.7 
 
 		 167 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  51.22 
 
 		 147 aa  131  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  42.42 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  42.61 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  38.95 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  53.78 
 
 		 168 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  51.26 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  51.26 
 
 		 163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  42.59 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  38.37 
 
 		 222 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  42.33 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  41.14 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  43.33 
 
 		 151 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  50.43 
 
 		 186 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  37.97 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  37.58 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  36.08 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  36.08 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  33.66 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5000  DNA repair protein RadC  40.49 
 
 		 204 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  54.37 
 
 		 166 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  35.2 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  52.43 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  39.87 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  35.43 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  33.17 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  36.69 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  39.19 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  32.75 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  48 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  32.2 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  33.73 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>