More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5000 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5000  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  49.71 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  44.77 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  44.83 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  45.35 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  47.37 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 229 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  40.99 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  41.54 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  48.76 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  36.65 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 236 aa  111  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  35.88 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  36.25 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  37.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  30.69 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  36.72 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  36.77 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  34.55 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  35.9 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  31.95 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  35.54 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  34.23 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  31.07 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  31.71 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  41.8 
 
 		 227 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  34.78 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  28.74 
 
 		 229 aa  94.7  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  35.58 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  33.53 
 
 		 241 aa  94  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  40.3 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  33.16 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  33.16 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  33.13 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  32.79 
 
 		 243 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  34.73 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  31.14 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  33.13 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  39.67 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  33.53 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 246 aa  90.5  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  40.5 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  41.35 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1227  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.179342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  31.74 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  36.67 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  40.5 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  34.52 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  41.13 
 
 		 151 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  33.53 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  37.1 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  37.1 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 220 aa  88.2  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 221 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 221 aa  87.8  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  41.82 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  41.82 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  41.82 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 158 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  32.56 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  40.17 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  35.83 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  30.22 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  34.01 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  33.85 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  32.35 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  31.14 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  32.93 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  33.61 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  38.71 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  36.97 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>