181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0738 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  48.33 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  49.69 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  47.54 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.45 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  46.2 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  45.74 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  43.92 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  40.23 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  39.89 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  41.71 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  36.76 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.55 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  39.13 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  34.59 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  35.87 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  37.1 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  34.78 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  41.14 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  35.14 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  35.14 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  35.14 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  35.14 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  33.51 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  34.22 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  34.41 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  33.15 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  37.57 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  33.15 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  37.5 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.78 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.09 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  33.88 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  34.78 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  32.04 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  35.9 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  32.43 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  29.57 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.03 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.87 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  30.2 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.67 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  27.03 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.43 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  27.37 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.22 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  28.08 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  28.08 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  27.52 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.89 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.32 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.46 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.46 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.87 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.31 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.11 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  26.56 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  32.89 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  28.08 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.08 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.54 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.05 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.49 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  27.52 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  27.47 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.79 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.75 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.86 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  23.63 
 
 		 168 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.5 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.47 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.7 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.48 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.23 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.47 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  23.26 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.84 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>