106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3090 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  54.8 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  51.93 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  54.8 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  53.11 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  51.34 
 
 		 182 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  53.71 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  48.07 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  47.31 
 
 		 181 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  46.67 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  50 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  50 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  50 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  50 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  50 
 
 		 183 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  53.59 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  53.11 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  52.27 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  49.71 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  47.51 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  48.07 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  50.28 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  50.28 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  50.28 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  52.2 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  47.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  47.28 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  47.34 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  43.41 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.62 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  44.62 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  39.57 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  37.1 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.5 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  39.87 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  36.27 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  38.12 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.83 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.16 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  37.87 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  40 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.78 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.5 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.81 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  27.69 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.11 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.2 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.75 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.96 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.5 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  29.48 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3469  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.89 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  28.96 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  28.32 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  28.9 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  28.9 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  28.9 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3480  metallophosphoesterase  26.7 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0474514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  28.9 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  28.9 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.05 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  28.9 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  28.9 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.37 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  35.58 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  28.9 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2771  metallophosphoesterase  28.7 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.96 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.12 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.09 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  26.73 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.55 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  30.46 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  30.12 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  31.58 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  31.58 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  31.09 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  31.84 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.07 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.79 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  27.91 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  32.02 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.57 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.12 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  24.52 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.27 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 168 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  28.57 
 
 		 178 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>