122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3113 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 154 aa  310  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  97.4 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  42.58 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  47.1 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  45.45 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.95 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  41.56 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  37.24 
 
 		 166 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.36 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  34.69 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  39.84 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.21 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  36.22 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.57 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.54 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.7 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.64 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  36.05 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.52 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  32.88 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  32.88 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  32.88 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.84 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  32.88 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  32.88 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  32.19 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  32.88 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  32.19 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  32.19 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  29.38 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.9 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.38 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  32.88 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  29.05 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  29.05 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  31.71 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  28.24 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  26.11 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.3 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  30.2 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  28.49 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  33.97 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.68 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  30.19 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.19 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.61 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.45 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  25.41 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.06 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.57 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  30 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  31.19 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  32.34 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.93 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.47 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  33.82 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  32.57 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  24.83 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  29.53 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  30.22 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.6 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.37 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  28.24 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.08 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.38 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  25.32 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0682  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0388677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  32.86 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  32.86 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.88 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  31.63 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>