100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1322 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 165 aa  347  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  38.85 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  35.26 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  35.26 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  34.9 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.74 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  36.17 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  34.39 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.28 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  34.38 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  32.82 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  38.52 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  26.4 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.73 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  34.01 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  31.01 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.39 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  32.14 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.53 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  30.12 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.52 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  31.52 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  29.25 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  32.81 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.71 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.1 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.06 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  28.4 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32.23 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  27.34 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.15 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  28.05 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  42.65 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.98 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  34.23 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.85 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  29.88 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.81 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  27.16 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  28.65 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  27.54 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.16 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.61 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.86 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  30.48 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  25.95 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.95 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.15 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.95 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  26.2 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.2 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.87 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.81 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  24.1 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.47 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.78 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.06 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  24.72 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  31.82 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.85 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.63 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  24.7 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  27.59 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  23.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  27.97 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.26 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  22.15 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.48 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.32 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  28.35 
 
 		 154 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  29.25 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  26.32 
 
 		 182 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  25.81 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  27.1 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  27.1 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  27.1 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  27.1 
 
 		 167 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.38 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  26.45 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25.81 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.45 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>