155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0852 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
163 aa  333  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  65.85 
 
 
169 aa  228  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  50 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  49.35 
 
 
167 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  48.7 
 
 
167 aa  158  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  48.05 
 
 
167 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  48.39 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  39.76 
 
 
172 aa  117  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  38.51 
 
 
167 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  42.65 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  36.2 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  34.76 
 
 
173 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.97 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  37.5 
 
 
167 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  37.5 
 
 
167 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  33.33 
 
 
177 aa  97.1  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  36.47 
 
 
178 aa  92  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  46 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.9 
 
 
159 aa  91.3  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
178 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.07 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  35.46 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.67 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.17 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  32.89 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  40.5 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  39.58 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  37.33 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.17 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.84 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  33.33 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.59 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.55 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.52 
 
 
173 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.56 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.55 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.68 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  25.79 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  29.49 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.33 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.61 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.03 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  25.57 
 
 
219 aa  60.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.94 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  34.01 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  36.89 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.32 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  39.39 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  32.59 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  25.99 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  28.33 
 
 
196 aa  58.9  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  39.39 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  39.39 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  39.39 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  39.39 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  35.29 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  25.32 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  33.01 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.14 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  28.75 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  31.25 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  36 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  31.86 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.7 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  32.04 
 
 
187 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  33.04 
 
 
183 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  28.93 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  35.35 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  33.94 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  36.56 
 
 
681 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  34 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  34.34 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  34.34 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  32.7 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.06 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  34.34 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  37 
 
 
189 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.88 
 
 
172 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>