146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0076 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  91.41 
 
 
163 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  92.02 
 
 
163 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  76.83 
 
 
164 aa  259  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  56.55 
 
 
168 aa  190  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.96 
 
 
160 aa  111  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.52 
 
 
181 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.75 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  35.15 
 
 
161 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  31.33 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.16 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.85 
 
 
210 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  31.29 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  33.53 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  32.28 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.15 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  30.38 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  30.38 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.63 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.43 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  32.03 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  30.99 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.34 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.9 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  31.9 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  35.51 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.05 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.27 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  29.81 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  29.09 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.88 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.99 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.06 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  26.92 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  27.88 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.25 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.12 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.74 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.92 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.66 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.85 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.43 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.52 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  27.54 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  32.93 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  25.41 
 
 
195 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.37 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.79 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.44 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  30 
 
 
203 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  26.97 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  27.33 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  30.57 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  27.33 
 
 
188 aa  58.9  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  28.93 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  29.93 
 
 
200 aa  58.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.98 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.98 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.5 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  26.54 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.32 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  26.32 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  26.32 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  26.32 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  26.32 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.4 
 
 
185 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  26.32 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.32 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  29.75 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.1 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.32 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.98 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  26.19 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  28.25 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  26.32 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  25.66 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  31.21 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.49 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.76 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  28.09 
 
 
188 aa  53.9  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.79 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  32.3 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.47 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  32.3 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.82 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.25 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  31.54 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  28.1 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  25.56 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  28.31 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>