115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1231 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  100 
 
 		 173 aa  355  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  64.85 
 
 		 166 aa  237  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  50.3 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  51.52 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  49.7 
 
 		 168 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  43.9 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  43.2 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.88 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  38.51 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  38.51 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  39.16 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  38.6 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  34.3 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  37.65 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  33.72 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  33.14 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  32.75 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.8 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  31.48 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  34.91 
 
 		 163 aa  97.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.5 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.13 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  27.81 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.93 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  35 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  31.29 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.94 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  31.29 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  28.65 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  32.52 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  31.47 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  27.61 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.94 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  32.91 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.1 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.91 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  27.81 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  31.91 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.18 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.52 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.43 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  28.81 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.09 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.08 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.34 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  35.46 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.25 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.25 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.53 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  29.79 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.94 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  30.22 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.21 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.3 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  34.04 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.41 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.61 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.65 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.29 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.39 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  31.1 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  32.87 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  31.43 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  24.34 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  31.91 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.49 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.49 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.26 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.38 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  26.9 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.17 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.25 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  28.32 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.1 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  29.58 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  28.89 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  26.14 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  28.83 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  26.76 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  26.59 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  28.28 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  28.28 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  28.28 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.79 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>