70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2678 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  92.41 
 
 		 176 aa  301  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  40.97 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  38.1 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.51 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  36.71 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  33.12 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  31.85 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  33.55 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  33.55 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.73 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  33.13 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  32.53 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  33.12 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.65 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  31.29 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.34 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.65 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.74 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  31.82 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  31.25 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  28.31 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.34 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.51 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.61 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  31.11 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  32.12 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  35.04 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  31.03 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.31 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  31.88 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  32.85 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.93 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  30.66 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  23.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.5 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.5 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  23.2 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  27.41 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  20.36 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  27.71 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1211  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0673  hypothetical protein  27.92 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.28 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  25.49 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.14 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  44.23 
 
 		 216 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.19 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  27.94 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.32 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.97 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.9 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 		 172 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.28 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  24.24 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.26 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.5 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.29 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.17 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  30.08 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1410  metallophosphoesterase  23.75 
 
 		 258 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000149653  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  25.55 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>