79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1588 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  100 
 
 
176 aa  350  7e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  47.9 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  47.24 
 
 
166 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  48.5 
 
 
175 aa  144  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  46.71 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  38.79 
 
 
171 aa  125  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.01 
 
 
167 aa  124  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  37.58 
 
 
171 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  38.6 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  37.58 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  36.97 
 
 
171 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  37.65 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  41.25 
 
 
158 aa  114  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  41.25 
 
 
158 aa  114  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  40.61 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  36.14 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  37.13 
 
 
168 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.67 
 
 
167 aa  98.2  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  37.76 
 
 
163 aa  95.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.13 
 
 
166 aa  94.4  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  36.75 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.04 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.97 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  33.73 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  31.68 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  33.13 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.3 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.46 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.11 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  30.23 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  28.92 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.15 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  26.7 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.46 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.67 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.7 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.19 
 
 
163 aa  54.3  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  32.61 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.56 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  33.57 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  24.1 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.88 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.51 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.95 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  26.85 
 
 
163 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.06 
 
 
148 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  28.99 
 
 
152 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  31.37 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  25.63 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.59 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  27.74 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  28.14 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  26.17 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.68 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.42 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.99 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.17 
 
 
154 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  30.99 
 
 
151 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  25 
 
 
163 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.46 
 
 
171 aa  44.3  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.37 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  29.68 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.07 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  27.86 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  26.47 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.53 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.37 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  25.91 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  25.99 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.37 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.27 
 
 
210 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  23.7 
 
 
238 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.41 
 
 
181 aa  42  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  23.16 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  29.79 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>